是的，Chrome浏览器下载记录消失可能是由于清理工具误操作导致的。在Windows系统中，可以使用系统自带的“磁盘清理”功能来删除临时文件和系统缓存。但是，这个功能并不能清除浏览器的下载记录。
如果你需要清除浏览器的下载记录，可以尝试以下方法：
1. 打开Chrome浏览器，点击菜单栏的“设置”按钮，然后选择“历史记录”。
2. 在“历史记录”页面，点击“清除浏览数据”按钮，然后勾选“下载历史记录”。
3. 点击“清除数据”按钮，等待下载记录被清除。
4. 如果需要永久删除下载记录，可以右键点击下载的文件，选择“移动到桌面”，然后在桌面上删除该文件。